婴儿脑部重量占体重的1/4，而成人这一比例为1/38~1/40。另外，新生儿颈部比较柔软，没有足够的力量支撑头部，不能有效地控制头颈部的运动，同时大脑体积小于颅脑体积，且漂浮在脑脊液中。所以在高抛、摇荡时，两者发生速度差，形成一种剪切力，使致密坚硬的颅骨与柔嫩脆弱的脑组织相互碰撞，造成脑部的损伤。
婴儿摇荡综合征可导致婴儿失明、癫痫、脑瘫、智力受损、学习障碍，严重时甚至会引起死亡。头部受损较轻的预后较好，但是这些患儿普遍存在学习障碍、人格改变、行为异常等现象。头部受损伤较重则会引发轻度精神发育迟缓、癫痫发作、身体发育迟缓、脑瘫等。这些症状在受损的当时很难被发现，所以要防止此综合症的发生，预防是关键。
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